Doctorado en Ciencias · 2026
Análisis de COV por HS-SPME GC/MS presentes en aliento exhalado de pacientes con cáncer gástrico de una población del departamento de Caldas para la identificación de potenciales biomarcadores mediante una aproximación metabolómica
El cáncer gástrico presenta altas tasas de mortalidad asociadas frecuentemente a un diagnóstico tardío mediante métodos invasivos y costosos. El objetivo de esta investigación fue analizar los compuestos orgánicos volátiles (COV) presentes en el aliento exhalado de pacientes del departamento de Caldas, Colombia, para identificar potenciales biomarcadores de cáncer gástrico mediante una aproximación de metabolómica no dirigida. Para ello, se optimizó la extracción de COV utilizando microextracción en fase sólida del espacio de cabeza acoplada a cromatografía de gases y espectrometría de masas (HS-SPME-GC-MS). Se evaluaron diferentes fibras adsorbentes, se analizó la estabilidad preanalítica de las muestras bajo distintas condiciones de almacenamiento y se caracterizó el perfil volatilómico de los participantes distribuidos en tres cohortes: voluntarios sanos, sintomáticos con afecciones benignas y voluntarios con diagnóstico de cáncer gástrico. Los resultados experimentales demostraron que la fibra comercial DVB/CAR/PDMS presenta la mayor eficiencia de preconcentración, siendo la temperatura y la agitación los factores termodinámicos determinantes para maximizar la sensibilidad analítica. El estudio de estabilidad temporal de 73 metabolitos confirmó que el almacenamiento a -20 °C reduce significativamente el coeficiente de variación frente al almacenamiento de muestras a temperatura ambiente, mitigando la degradación de la muestra y permitiendo establecer una línea basal robusta. En la fase clínica, el procesamiento quimiométrico y la implementación de algoritmos de aprendizaje automático (PLS-DA y Random Forest) aislaron los COV con mayor poder discriminante. Se identificó un panel de biomarcadores liderado por hexanal, isopreno y tolueno, el cual alcanzó rendimiento diagnóstico destacado con un área bajo la curva (AUC) de 0.96 para discriminar pacientes oncológicos de controles sanos, y de 0.91 frente a pacientes sintomáticos. Biológicamente, las alteraciones en estos biomarcadores evidencian una reprogramación sistémica asociada a la carcinogénesis, correlacionándose con un incremento en la peroxidación lipídica y disrupciones en la vía del mevalonato. La estandarización metodológica lograda en esta investigación garantiza la alta reproducibilidad del análisis de aliento exhalado. El modelo multivariado propuesto demuestra alta precisión diagnóstica y proporciona evidencia metodológica para el desarrollo de futuras herramientas de tamizaje oncológico no invasivas.
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Contenido
- Introducciónp. 19
- Planteamiento del problema y pregunta de investigaciónp. 23
- Marco Teórico (biomarcadores y cáncer gástrico)p. 26
- Metabolómica en la saludp. 25
- Definiciones y principios generalesp. 25
- Rol de la metabolómica en las ciencias ómicasp. 26
- Clasificación de los estudios en metabolómicap. 28
- Justificación y aplicabilidad en el ámbito clínicop. 29
- Metabolismo relacionado con enfermedadesp. 30
- Metabolismo celular: rutas relevantes implicadas en patologíasp. 31
- Metabolitos primarios y secundarios relacionados con salud/enfermedadp. 32
- Alteraciones metabólicasp. 34
- estudios metabolómicosp. 35
- Cromatografía de gases para análisis de COVp. 36
- Técnicas de extracción para análisis de COVp. 37
- Flujo de trabajo y procesamiento de datosp. 38
- Adquisición de datosp. 38
- Métodos estadísticos utilizados en el análisis de datosp. 39
- Plataformas bioinformáticasp. 40
- Metabolómica en cáncer: fundamentos y aplicación clínicap. 41
- Estado del arte de la metabolómica clínica relacionada con el cáncerp. 44
- Metodologías para detección de cáncer y plataformas predominantesp. 47
- Aplicaciones de estudios metabolómicos clínicos en cáncer actualesp. 48
- Cienciometría de la metabolómica clínica en los últimos añosp. 48
- Estado actual del cáncer gástricop. 49
- Cáncer gástrico en Colombiap. 50
- Biomarcadores y validación clínica en cáncer gástricop. 51
- Materiales y Métodosp. 55
- Selección de Fibras SPMEp. 55
- Condiciones cromatográficasp. 56
- Diseño experimentalp. 57
- Análisis factorialp. 57
- Validación del modelop. 58
- Optimización por superficie de respuestap. 58
- Análisis de la estabilidad de las muestras de aliento exhaladop. 59
- Consideraciones éticasp. 59
- Manejo, custodia y protección de datos sensiblesp. 60
- Extracción de metabolitos SPMEp. 61
- Volatilómica no dirigida a través de GC-MSp. 62
- Adquisición y pre-procesamiento de datosp. 63
- Identificación de metabolitosp. 63
- Procesamiento de datos y análisis estadísticop. 64
- aliento exhaladop. 64
- exhaladop. 65
- Procesamiento de datos y análisis estadísticop. 64
- Aseguramiento de la Calidad y Control de Calidad (QA/QC)p. 70
- Reproducibilidad y entorno de softwarep. 71
- Resultados y Discusiónp. 73
- estándares de COVp. 73
- Validación del modelop. 58
- Análisis de resultados por el método de superficie de respuestasp. 79
- Estudio de estabilidad de muestras de aliento exhaladop. 80
- almacenamientop. 85
- condiciones de almacenamientop. 85
- en muestras de alientop. 87
- biomarcadoresp. 96
- de almacenamientop. 93
- biomarcadores con fines de uso en diagnósticos clínicosp. 96
- Identificación de potenciales biomarcadores de cáncer gástricop. 64
- Descripción de la población de estudiop. 98
- Perfil volatilómico global del aliento exhalado en los grupos de estudiop. 99
- Análisis univariado de los COV diferencialesp. 102
- sintomáticos sin cáncer y voluntarios sanosp. 107
- Biomarcadores volátiles candidatos y desempeño diagnósticop. 115
- Interpretación biológica y relevancia clínica de los COV identificadosp. 120
- Perspectivas metodológicas y alcance traslacionalp. 125
- Limitaciones del estudiop. 127
- Conclusiones y Recomendacionesp. 128
- Conclusionesp. 128
- Recomendacionesp. 131
- Productos de investigaciónp. 132
- Anexosp. 137
- Referenciasp. 144
- Tabla 1. Ventajas y limitaciones de los tipos de estudios en metabolómicap. 28
- frente a los cuatro estándaresp. 57
- Tabla 3. Resumen de significancia de efectos principales e interaccionesp. 76
- Tabla 4. Resumen estadístico de los modelos de superficie de respuestap. 79
- significancia estadística entre condiciones de refrigeraciónp. 81
- almacenamientop. 85
- Tabla 7. Características demográficas y clínicas basales de la población de estudiop. 98
- cáncer gástrico frente a controles sanosp. 104