Bogotá - Ciencias Agrarias - Maestría en Ciencias Agrarias · 2026

Caracterización de Dematophora spp. y desarrollo de una técnica isotérmica LAMP para el diagnóstico de Ceratocystis sp. y Dematophora sp. en cacao (Theobroma cacao L.)

El mal del machete o marchitamiento vascular causado por Ceratocystis cacaofunesta y la pudrición negra de la raíz por Dematophora spp. (sin. Rosellinia spp.), se han convertido en enfermedades de gran relevancia en los cultivos de cacao (Theobroma cacao L.), ya que la sintomatología se manifiesta típicamente en etapas avanzadas de la infección. Pese a su importancia, en Colombia se tienen escasos estudios de caracterización de aislamientos de Dematophora sp. asociados al cacao. Esto limita la comprensión de su diversidad y dificulta el desarrollo de métodos diagnósticos específicos. A esto se suma la escasez de técnicas de detección temprana de estos dos patógenos, lo que conlleva a emplear procedimientos tradicionales que demandan tiempos prolongados y equipos especializados de alto costo. Debido a ello, las herramientas moleculares como la amplificación isotérmica mediada por bucle (LAMP) podría utilizarse como un método rápido y sensible de diagnóstico, incluso en material vegetal asintomático. Por ende, esta investigación tuvo como objetivo caracterizar aislamientos de Dematophora sp. y diseñar una prueba LAMP para la detección temprana de Ceratocystis sp. y Dematophora sp. en cacao. Se realizó la caracterización de 17 aislamientos de Dematophora sp. provenientes de cuatro regiones cacaoteras de Colombia. A nivel morfológico se evaluaron características macro y microscópicas y se hizo un análisis de componentes principales y factorial de datos mixtos para hacer agrupaciones. A nivel molecular se hizo un análisis filogenético multilocus usando las regiones ITS y LSU y los genes βT y RPBII para identificar los aislamientos a nivel de especie. Posteriormente, se realizó el diseño de cebadores LAMP para la detección de Ceratocystis sp. y Dematophora sp., determinando la especificidad y sensibilidad de la prueba. Se realizaron pruebas de patogenicidad de C. cacaofunesta y Dematophora spp. en plántulas susceptibles de cacao CNN-51 e IMC-67 respectivamente. Como resultados, con el análisis de las características morfológicas de los aislamientos de Dematophora sp. se obtuvieron cinco grupos morfológicos contrastantes. A nivel molecular se encontró que doce de los aislamientos se identifican como Dematophora pepo. Con la estandarización de la prueba LAMP se logró realizar la detección temprana de Ceratocystis sp. y Dematophora sp. en plántulas de cacao, con un límite de detección de 0,005 ng/µL y 0,0005 ng/µL respectivamente, siendo 1000 veces más sensible que una PCR de punto final. Con este estudio se aportan nuevos conocimientos a nivel morfológico, molecular y epidemiológico de las especies del género Dematophora que afectan al cacao en Colombia, al igual que nuevas herramientas de detección molecular isotérmicas para el diagnóstico temprano de patógenos vasculares y radicales de cacao. (Texto tomado de la fuente)