AAA. Tesis y Trabajos de Grado · 2020

Análisis genómico comparativo de las cepas de Helicobacter pylori: evidencia evolutiva de su patogenicidad

Helicobacter pylori es una bacteria patogénica que coloniza el tracto gastrointestinal del estómago humano; causante de enfermedades como gastritis, úlcera péptica, linfoma gástrico (MALT) y cáncer gástrico, con mayor prevalencia en países subdesarrollados. Su gran diversidad genética es causada por una alta tasa de mutaciones, observándose variaciones en los factores de virulencia en los diferentes linajes filogeográficos. Este proyecto tuvo como objetivo, postular los eventos de evolución en los genes asociados a factores de virulencia presentes en las cepas de Helicobacter pylori, con el fin de identificar la relación de estos genes con su origen filogeográfico. Se analizaron por medio de herramientas bioinformáticas, los genomas completos de 135 cepas disponibles en NCBI, de diferentes orígenes poblacionales, identificando eventos de reorganización génica en 87 genes de factores de virulencia, divididos en 7 grupos funcionales, para así, determinar cambios en la posición, número de copias, identidad nucleotídica y tamaño, contrastándolos con su linaje geográfico y fenotipo patogénico. Como resultado se demuestran que no hay una relación directa entre el nivel de reorganización con el linaje geográfico. Sin embargo, si se puede evidenciar una relación en el fenotipo patogénico demostrada en el análisis de número de copias, tamaño y similitud al dividirse las cepas que poseen y no las citotoxinas cagPAI teniendo mayor riesgo de desarrollar gastritis y úlcera péptica. Estudios evidencian el impacto funcional y patogénico de las reorganizaciones en cepas de bacterias patogénicas, pero solo en algunos factores de virulencia de mayor interés como cag y vacA.

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