Doctorado en Microbiología y Salud Tropical · 2026
Ecoepidemiología y comportamiento espacio-temporal de la leptospirosis humana en el departamento del Atlántico, Colombia: abordaje basado en el enfoque una sola salud
La leptospirosis es una zoonosis bacteriana reemergente de distribución global, prevalente en regiones tropicales y subtropicales. Es causada por espiroquetas del género Leptospira y se transmite principalmente a través del contacto con agua o suelos contaminados con la orina de animales infectados, especialmente roedores. En el departamento del Atlántico, Colombia, la enfermedad presenta una dinámica compleja influenciada por factores ambientales, sociales y biológicos. Sin embargo, la leptospirosis ha sido poco analizada de forma integral mediante el enfoque Una Sola Salud. Objetivo. Determinar el comportamiento eco-epidemiológico de la leptospirosis y sus factores de riesgo en el departamento del Atlántico, mediante un enfoque integral de Una Sola Salud. Metodología. Se desarrolló un estudio eco-epidemiológico descriptivo con dos componentes. El primero incluyó el análisis espacial y temporal de casos humanos reportados entre 2009 y 2024. Los casos se analizaron con los datos de incidencia de leptospirosis secretaría de salud del departamento del Atlántico y del Instituto Nacional de Salud de Colombia. Para el análisis de la tendencia de la mortalidad en Colombia y el impacto del subregistro en la salud pública, se utilizaron los datos de mortalidad de los registros oficiales de estadísticas vitales del DANE del periodo 1997-2022. Los datos anuales de los 33 departamentos fueron analizados para identificar los patrones espaciales y temporales de la mortalidad. Para identificar la mortalidad por leptospirosis se usaron los códigos de la 10ª Clasificación Internacional de Enfermedades. Las tasas de mortalidad se calcularon por 100.000 habitantes para cada departamento y para el país. Para describir las tendencias de las tasas de mortalidad, se utilizó el “Joinpoint Regression Program”, descrita en “Methodology for Characterizing Trends” of the National Cancer Institute of the United States.
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Contenido
- GLOSARIO DE TÉRMINOSp. 9
- RESUMENp. 11
- ABSTRACTp. 13
- 1. INTRODUCCIÓN Y JUSTIFICACIÓNp. 15
- SALUDp. 27
- 2. ANÁLISIS Y FORMULACIÓN DEL PROBLEMAp. 33
- 3. OBJETIVOSp. 38
- 3.1. OBJETIVO GENERALp. 42
- 3.1. OBJETIVOS ESPECÍFICOSp. 42
- 4. MATERIALES Y METODOSp. 40
- 4.1. TIPO DE ESTUDIOp. 43
- 4.2. ÁREA DE ESTUDIOp. 40
- 4.2.1. Contexto geográfico y ambiental del departamento del Atlánticop. 43
- 4.2.2. Consideraciones éticasp. 45
- 4.3. METODOLOGÍA DEL OBJETIVO ESPECÍFICO UNOp. 44
- Atlánticop. 60
- del Atlántico durante el periodo 2007-2022p. 47
- 4.4. METODOLOGÍA DEL OBJETIVO ESPECÍFICO DOSp. 46
- geoespacial de la leptospirosis en el departamento del Atlánticop. 48
- 4.4.2. Georreferenciaciónp. 48
- 4.4.3. Variables ambientales y modelo predictivop. 48
- 4.4.4. Cobertura de suelo (Land cover type)p. 48
- 4.4.5. Densidad poblacionalp. 49
- 4.5. METODOLOGÍA DEL OBJETIVO ESPECÍFICO TRESp. 49
- 4.5.1. Captura de roedores sinantrópicosp. 50
- búsqueda de leptospirap. 52
- Leptospirap. 52
- de campo oscurop. 53
- 4.5.5. Implementación del cultivo para leptospirasp. 53
- 4.5.6. Extracción de ADN totalp. 54
- roedores y las muestras de aguap. 54
- 4.6. METODOLOGÍA DEL OBJETIVO ESPECÍFICO CUATROp. 55
- secuenciación y análisis filogenéticop. 55
- 4.6.2. Selección de genomasp. 55
- 4.6.3. Identificación de ortólogos conservadosp. 55
- 4.6.4. Alineamiento múltiple de secuenciasp. 55
- 4.6.5. Filtrado y trimming del alineamientop. 55
- 4.6.6. Construcción y visualización del árbol filogenéticop. 55
- 5. RESULTADOSp. 57
- EL DEPARTAMENTO DEL ATLÁNTICOp. 38
- reportados por el DANE, 1997-2022p. 56
- SOCIOECONÓMICOS DEL DEPARTAMENTO DEL ATLÁNTICOp. 62
- creación del modelo predictivop. 62
- 5.2.2. Mapa predictivo mediante modelo de nichos ecológicosp. 66
- CUERPOS DE AGUAp. 38
- molecular mediante qPCRp. 73
- 5.3.2. Muestras de aguap. 77
- CIRCULANTES EN EL DEPARTAMENTO DEL ATLÁNTICOp. 77
- secuenciación y análisis filogenéticop. 77
- 6. DISCUSIÓNp. 83
- COLOMBIA, 1997-2022p. 80
- DEPARTAMENTO DEL ATLÁNTICOp. 52
- 6.3. ANÁLISIS DEL MODELO PREDICTIVOp. 83
- MARGINALESp. 85
- 7. ANÁLISIS DE LOS RESULTADOS DE NUEVO CONOCIMIENTOp. 101
- 8. CONCLUSIONESp. 102
- 9. RECOMENDACIONESp. 104
- CONOCIMIENTO GENERADOSp. 92
- 11. REFERENCIASp. 106
- como un problema serio de salud públicap. 33
- Figura 2. Descripción de la metodología del trabajop. 41
- Figura 3. Departamento del Atlánticop. 43
- roedoresp. 44
- ROEDORES SINANTRÓPICOS Y TOMA DE MUESTRAS DE AGUASp. 50
- Shermanp. 51
- Departamento del Atlánticop. 52
- Figura 8. Identificación y eutanasia de roedores sinantrópicos capturadosp. 53
- de los roedores. M-p dna ladder plus,1 kb (invitrogen)p. 54
- 100.000 HABITANTES POR DEPARTAMENTO,1997–2022p. 58
- Colombia, mediante el índice de Moran I, 1997–2022p. 58
- Colombia, 1998–2022p. 60
- ATLÁNTICO, 1997-2022p. 61
- 2009–2016p. 65
- Atlántico, 2009-2016p. 67
- Departamento del Atlántico, 2009-2016p. 68
- leptospirosis humana en el Departamento del Atlánticop. 71
- variables ambientales en el modelo Maxentp. 72
- ocurrencia de Leptospirap. 73
- ocurrencia de Leptospirap. 73
- leptospirosis humana en el Departamento del Atlánticop. 71
- departamento del atlántico, Colombia, 2017p. 78
- Figura 23. Curva de qPCR TaqMan para leptospirosisp. 78
- Figura 25. Microscopia de campo oscuro de muestras de Leptospirap. 80
- Figura 26. Curva PCR tiempo real muestras de aislamientos en cultivop. 81
- identificadas mediante secuencia de una porción del gen 16Sp. 82
- predictivo. Departamento del Atlántico, Colombiap. 49
- departamento del Atlántico, 2009-2024p. 58
- por/100.000 habitantes, Colombia y departamento del Atlántico, 1997-1922p. 61
- al modelo de MaxEntp. 66
- Atlántico, Colombia, 2017p. 73