FDA. Monografías, Tesis y Trabajos de Grado · 2018
Identificación in silico, perfil de expresión y búsqueda de inhibidores de la familia de proteínas disulfuro isomerasa de Toxoplasma gondii
Identificación in silico, perfil de expresión y búsqueda de inhibidores de la familia de proteínas disulfuro isomerasa de Toxoplasma gondii Con un tercio de la población mundial infectada por Toxoplasma gondii, las infecciones oportunistas causadas por este parásito son una causa frecuente de complicaciones clínicas en personas inmunocomprometidas. Actualmente los tratamientos se enfocan en infecciones agudas, pero no son efectivos contra las demás etapas del ciclo de vida del parásito. Para identificar nuevos blancos farmacológicos, se realizó una comparación de niveles de expresión génica de múltiples etapas durante del ciclo de vida del parásito y se identificaron ortólogos en las especies de coccidios, Neospora caninum, Sarcocystis neurona, Hammondia hammondi y Eimeria tenella. Se identificaron 23 proteínas en el transcriptoma de T. gondii ME49, 23 con sintenia en N. caninum, S. neurona, H. hammondi y 3 en E. tenella. Estas proteínas contienen al menos un dominio de tiorredoxina, que es característico de la familia de proteínas disulfuro isomerasa (PDI), con frecuencias variables de dominios de tiorredoxina y diferentes arquitecturas que se comparten entre estos parásitos. Se describen los perfiles de expresión de proteínas estadio especifico durante los estadios taquizoito, bradizoito y de ooquistes y los de proteínas multi-estadio. Se propone a la proteína codificada por la secuencia genómica TGME49_211680 como un blanco farmacológico dado que tiene expresión multi-estadio y es la proteína con más expresión en las cepas arquetípicas durante la infección tanto de células humanas como de ratones en estadios crónicos y agudos y por tener evidencia de ser esencial para el estadio taquizoito. Encontramos en ensayos de invasión en fibroblastos de prepucio humano con bacitracina, un inhibidor conocido para proteínas PDI, reducción de los porcentajes de invasión de los taquizoitos. Estos resultados sugieren que la familia PDI tiene un papel en la invasión de taquizoitos y podría ser un blanco para nuevas intervenciones terapéuticas. Además, debido a la alta conservación de las 3 secuencias de esta familia de proteínas entre los coccidios, la familia PDI podría ser un blanco farmacológico importante para estos parásitos.
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Contenido
- Introducciónp. 13
- Materiales y métodosp. 17
- Identificación de la familia de proteínas disulfuro isomerasa (PDI)p. 17
- Obtención de transcriptomas de la familia PDIp. 17
- Análisis de transcriptomasp. 18
- Fenotipo del Knockout de la familia de proteínas disulfuro isomerasap. 18
- Producción de proteína recombinantep. 19
- Ensayos de inhibiciónp. 19
- Ensayos Inmunofluorescenciap. 20
- Cuantificación relativa de la PDI TGME49_211680 por RT-PCRp. 20
- la proteína TGME49_211680p. 20
- Resultadosp. 21
- Identificación de la familia de proteínas disulfuro isomerasa (PDI)p. 17
- Estadio entero epitelial de gatop. 31
- Perfil de expresión de las cepas ME49, VEG, GT1 taquizoitosp. 27
- Perfil de expresión en las formas clínicas agudo y crónicop. 35
- Fenotipo del knockout de la familia de proteínas PDIp. 37
- Ensayos de invasión e interacción proteína células hospedadorasp. 40
- Análisis estructural de la proteína PDI TGME49_211680p. 44
- Regiones funcionalesp. 44
- Dominios activosp. 46
- Dominios inactivosp. 49
- la proteína TGME49_211680p. 52
- Dominio a’p. 52
- Dominio b’ y región comprendida entre dominio b’ y enlazador xp. 55
- Discusiónp. 61
- Perfiles transcriptómicos de la familia de proteínas disulfuro isomerasap. 64
- isomerasa de T gondii GT1p. 65
- Análisis funcional de la proteína TGME49_211680p. 66
- potencial de inhibición de la proteína TGME49_211680p. 67
- Conclusionesp. 77
- Bibliografíap. 78
- proteínas disulfuro isomerasa de T gondiip. 22
- PDI de T gondiip. 24
- gondiip. 102
- cepas GT1, ME49 y VEG durante infección a células HFFp. 28
- VEG durante infección a células HFFp. 29
- Figura 6 A. Análisis de diferencia de medianas Kruskal-Wallisp. 30
- entero epiteliales de gatop. 32
- de gatop. 33
- T gondii en los estadios entero epiteliales de gatop. 34
- aguda y crónica en cerebro de ratónp. 35
- crónica en cerebro de ratónp. 36
- crónica en cerebro de ratónp. 37
- disulfuro isomerasa de T gondiip. 38
- la familia de proteinas PDI de T gondiip. 39
- Figura 15 Ontología de genp. 40
- Figura 16 Electroforesis de poliacrilamida al 12% y western blotp. 41
- 5:1p. 42
- la proteína TGME49_ 211680p. 43
- 211680 en células HeLa y Müllerp. 44
- Figura 20 Estructura general de PDI TGME49_211680p. 46
- TGME49_211680p. 23
- PDI TGME49_211680 y las proteínas humanas PDI A1 y ERP 57p. 50
- TGME49_211680p. 23
- inhibidores para PDI TGME49_211680p. 52
- sobre el sitio activo CGYC de PDI TGME49_211680p. 54
- CGYCp. 54
- sobre el dominio b’ de PDI TGME49_211680p. 55
- TGME49_211680p. 23
- enlazador x de PDI TGME49_211680p. 58
- Tabla 1. Resumen de las regiones funcionales de la familia PDIp. 23
- gondiip. 102
- sinteniap. 27
- TGME49_211680 y su comparación con las proteínas PDIA1 y ERP 57p. 55
- TGME49_211680, PDIA1 y ERP 57p. 59