Maestría en Microbiología · 2025
Caracterización de especies de Candida aisladas de pacientes adultos en Unidad de Cuidados Intensivos y sus factores asociados a la colonización
Introducción: La colonización por Candida spp. es considerada uno de los principales factores de riesgo asociado al desarrollo de candidiasis invasiva en los pacientes críticos. Por lo tanto, es fundamental estudiar a nivel local la prevalencia de colonización, distribución de especies y factores asociados para orientar la toma de decisiones clínicas. Objetivo: Determinar las especies de Candida que colonizan a los pacientes adultos en Unidad de Cuidados Intensivos, así como su asociación con las características sociodemográficas y clínicas. Metodología: Estudio observacional, analítico de corte transversal. Se determinó la colonización por Candida spp. en adultos al momento de ingreso a UCI en muestras de orina, hisopado de piel en axila, ingle, frotis faríngeo y aspirado traqueal. Se sembraron en SDAC 2% y CHROMagarTM Candida para determinar colonización mixta. Los aislamientos fueron identificados mediante RapID Yeast Plus, MALDI TOF y pruebas complementarias. Se realizó un análisis estadístico univariado, bivariado y multivariado determinando la prevalencia de colonización y factores asociados. Resultados: Se estudiaron 114 pacientes, el 73,7% (n=84) presentó colonización por Candida spp., siendo colonización monofocal en el 51,2%(n=43). La zona inguinal correspondió al sitio más colonizado (34,04%, n=48). En total se obtuvieron 183 aislamientos de Candida con predominio de C. albicans (43,7%, n=80) y un 56% de especies no albicans (n=103). La presencia de sepsis (RP=1,34 IC 95% 1,11-1,61, p= 0,020), infección bacteriana localizada (RP=1,31 IC 95% 1,08-1,58, p= 0,028) y cirugía reciente (RP=0,69 IC 95% 0,51-0,93, p= 0,004) se asoció a la colonización por Candida. Conclusiones: Se generaron los primeros datos en Santander sobre la colonización por Candida en pacientes críticos, evidenciando una alta prevalencia de colonización al ingreso a la UCI, con presencia diferencial de especies de Candida, y encontrando como factores asociados de mayor probabilidad de colonización la presencia de sepsis e infección bacteriana y de menor probabilidad de colonización la cirugía reciente.
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Contenido
- Introducciónp. 12
- Descripción del proyectop. 13
- Planteamiento del problema y justificaciónp. 13
- Objetivosp. 17
- Objetivo Generalp. 17
- Objetivos Específicosp. 17
- Cuerpo del trabajop. 18
- Marco conceptualp. 18
- Generalidades de Candida sppp. 18
- Unidad de Cuidados Intensivos y colonización por Candida sppp. 19
- Colonización e infección por Candida sppp. 19
- Factores de riesgo para colonización e infección por Candida sppp. 21
- Índices de predicción de colonización por Candida sppp. 21
- Métodos para la identificación de Candida sppp. 23
- 3.1.6.1 Métodos para la identificación presuntiva de Candida sppp. 23
- 3.1.6.2 Métodos para la identificación definitiva de Candida sppp. 24
- Antecedentesp. 25
- Metodologíap. 29
- Diseño del estudiop. 29
- Población y muestrap. 29
- Criterios de selecciónp. 30
- 3.3.3.1 Criterios de inclusión:p. 30
- 3.3.3.2 Criterios de exclusión:p. 30
- Variables de estudiop. 31
- Instrumento de recolección de datosp. 31
- Caracterización de los participantes del estudiop. 31
- Procesamiento de muestras clínicasp. 32
- Determinación de la colonización por Candida sppp. 33
- Criopreservación de los aislamientosp. 36
- Identificación de los aislamientos de Candida sppp. 36
- 3.3.10.1 Identificación por bioquímica y pruebas complementariasp. 36
- 3.3.10.1.1 Identificación por RapID Yeast Plusp. 36
- 3.3.10.1.2 Crecimiento en CHROMagar Candidap. 37
- 3.3.10.1.3 Agar tabacop. 117
- 3.3.10.2 Identificación por espectrometría de masas MALDI-TOFp. 37
- 3.3.10.3 Identificación molecular por secuenciación de región ITSp. 39
- 3.3.10.3.1 Extracción ADN de levadurasp. 39
- 3.3.10.3.2 Amplificación de región ITS por técnica de PCRp. 39
- 3.3.10.3.3 Secuenciación de región ITSp. 38
- 3.3.10.3.4 Análisis de secuenciasp. 41
- Análisis estadísticop. 42
- Aspectos éticosp. 43
- Resultadosp. 46
- Descripción sociodemográfica y clínica de los participantes del estudiop. 46
- Cuidados intensivosp. 50
- Distribución de especies de Candida colonizantep. 54
- Candida spp. en los participantes del estudiop. 59
- Análisis bivariadop. 59
- Análisis multivariadop. 62
- Discusión de resultadosp. 64
- Conclusionesp. 77
- Recomendacionesp. 78
- Referencias Bibliográficasp. 79
- Apéndicesp. 94
- Tabla 1 Estimación del tamaño de muestra del estudiop. 30
- Tabla 2 Composición de la reacción de PCRp. 40
- Tabla 3 Condiciones de la PCRp. 41
- Tabla 4 Características sociodemográficas de los participantes del estudiop. 46
- Tabla 5 Primera parte, características clínicas de los participantes del estudiop. 47
- Tabla 6 Segunda parte, características clínicas de los participantes del estudiop. 48
- Tabla 8 Colonización por Candida spp. según el sitio anatómicop. 53
- Tabla 10 Distribución de Candida spp. en general y por sitio anatómicop. 55
- Tabla 11 Distribución de levaduras general y por sitio anatómicop. 57
- ITSp. 115
- colonizadosp. 51
- Tabla 15 Modelo de regresión propuestop. 63
- Tabla 16 Interpretación de las pruebas del sistema RapID Yeast Plus:p. 122
- Figura 1 Técnicas de siembra empleadas para el procesamiento de muestras clínicasp. 33
- ™ Candida (derecha)p. 34
- Figura 3 Impronta del cultivo primario utilizando sello replicadorp. 35
- replicadorp. 51
- replicadorp. 52
- Figura 6 Colonización por única especie de Candida spp. usando el sello replicadorp. 52
- (PCA)p. 58
- Figura 8 Formato de registro de resultados del sistema RapID Yeast Plus:p. 122
- NCPF ATCC 3949 (derecha)p. 123
- (izquierda) y presencia de clamidoconidias (derecha)p. 124
- Figura 11 Muestras en gradilla magnética para recolección de las perlas magnéticasp. 129
- Apéndice A. Consentimiento informado del macroproyectop. 94
- Apéndice B Tabla de operacionalización de variablesp. 99
- Apéndice C Instrumento de recolección de datos clínicos y sociodemográficosp. 116
- Apéndice D Instrumento de recolección de datos microbiológicosp. 117
- Apéndice E Agar Sabouraud 2%. (SDA-Merck)p. 118
- Apéndice F CHROMagarTM Candidap. 119
- 2004)p. 120
- Apéndice H Agar tabaco (Girish Kumar & Menon, 2005)p. 123
- Apéndice I Extracción total de proteínas y montaje para identificar por MALDI-TOFp. 125
- Apéndice J Preparación y montaje del Bacterial Test Standard (BTS – Bruker Daltonik)p. 127
- Acid Isolation Kitp. 128
- Apéndice L Aval del Comité de ética en investigación CEINCIp. 131